袁一楠

理解树木生长和发育中的反义转录

我有兴趣破译非编码 RNA (ncRNA) 在控制林木生长和发育的基因调控网络中的功能作用。此类 ncRNA 的一类重要类别是天然反义转录本 (NAT)，其与蛋白质编码基因共享互补序列。最近在直接转录组测序（RNA-seq）和全基因组平铺阵列方面的研究表明，包括植物基因组在内的真核基因组编码大量从相反的基因链（cis-NAT）或从不同的染色体位置（trans-NAT）转录的NAT。 NAT 的大量出现代表了一种重要的基因现象，但尚未在树木基因组中得到表征。

为了揭示树木基因组的这些隐藏转录本，我们采用了一种新颖的实验方法来系统鉴定植物中的胁迫响应 NAT。通过基于 Cas13d 的单株特异性 RNA 干扰敲除分析，在杨树和拟南芥中探索了已识别 NAT 的功能。我研究的最终目标是揭示林木生长和发育背后的 NAT 介导的调控网络。产生的结果将推进我们当前的树木生物学知识基础，以实现“超级”林木的高效生长、管理和遗传操作。