袁一楠

理解树木生长和发育中的反义转录

我有兴趣破译非编码 RNA (ncRNA) 在基因中的功能作用 林木生长发育的调控网络。一节重要的课 这种 ncRNA 的一部分是天然反义转录本 (NAT)，它们共享互补序列 与蛋白质编码基因。直接转录组测序（RNA-seq）的最新研究 全基因组平铺阵列揭示了包括植物在内的真核基因组 基因组编码大量从相反的基因链转录的 NAT （顺式 NAT）或来自不同的染色体位置（反式 NAT）。压倒性的发生 NAT 代表了一种重要的基因现象，但尚未在 树基因组。

为了揭示树木基因组的这些隐藏转录本，我们采用了一种新颖的实验方法 用于系统鉴定植物中的胁迫响应 NAT。功能性 通过基于 Cas13d 的方法在杨树和拟南芥中探索了已识别的 NAT 特异性RNA干扰敲除分析。我研究的最终目标 目的是揭示森林树木生长过程中 NAT 介导的调控网络 和发展。产生的结果将推进我们当前的知识库 用于“超级”森林高效生长、管理和基因操纵的树木生物学 树。