即时足球比分 GUIDE-seq:用于标记 DNA 损伤的 DNA 胶带

指南主
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DNA 修复对于修复 DNA 中的双链断裂至关重要。结合新技术 基因编辑领域的研究可以更有效地检测植物中的这一过程。
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DNA 中的双链断裂可以通过多种技术检测到。这样做 在植物中进行测序非常困难,但 GUIDE-Seq 在新研究中显示出了前景。 

GUIDE-Seq 处理 DNA 双链断裂 (DSB),代表全基因组无偏倚 通过测序评估 DSB 的鉴定。基本上,技术寻找 损伤热点,管道胶带状的 DNA 片段可以密封受损的 DNA 并留下 那里有一个可识别的标记。通常,这些修复就像管道胶带修复一样 家——它们并不总是完美的。 GUIDE-Seq 可以有效地追踪磁带位置, 这可以帮助追踪 DNA 损伤和修复过程。

管道胶带对动物细胞有效。但植物细胞——其坚韧的细胞 墙壁——很难将胶带放入细胞中以标记 DNA 断裂。在聚光灯下 文章发表于植物科学的趋势 (),足球比赛结果的生物学家详细阐述了 GUIDE-Seq 如何发挥作用 成为观察植物 DNA 损伤、修复和进化的解决方案。 

基因编辑工具

受损的 DNA 在修复时有时会产生不匹配的序列,就像推入 衬衫扣子穿错了洞。这么小的错误会导致序列不均匀 这对基因蓝图产生了很大的影响。

“如果没有 DNA 修复,我们就无法生存,”唐桂良教授说道 足球比赛结果生物科学博士和该论文的通讯作者。他解释说 细胞会自然修复 DNA,现在,借助新技术 CRISPR-Cas9,基因 可以被人修改,这也需要DNA修复。

“大自然会引入随机的 DNA 损伤,这种损伤可能发生在基因组内的任何位置,”唐 解释说。 “虽然 CRISPR 可以引入非常特定的 DNA 损伤进行修饰 通过修复。”

GUIDE-Seq 检测到的最大问题是 CRISPR 脱靶,它服务于 作为剪切和粘贴基因编辑工具。然而,剪切和粘贴并不总是 不够精确,导致双链断裂之间的误修复。

幸运的是,正确和错误 DNA 修复的精确位置都可以检测到 通过胶带。在基因编辑工具包中,GUIDE-Seq 就像吸管 突出显示图像中相同颜色的所有部分的工具; DNA修复, 由管道胶带标记,可以通过 GUIDE-Seq 沿着损坏的区域精确定位 DNA 螺旋。DNA 修复过程图。

“这条胶带由非常短的 DNA 序列组成——大约 33 个核苷酸长——以找到 双链断裂,”唐说。 “短序列带来效率。”

短序列的结构和组成也很重要,这可以使 管道胶带色彩缤纷,可用于不同目的。例如,绿色管道 胶带更容易检测到有益基因上的 DNA 损伤,红色胶带可以检测到 不良基因的损伤等。唐的实验室目前正在测试管道胶带 不同颜色的。

植物遗传学

DNA 损伤和修复是植物进化、规格和进化的驱动力 驯化;它们还有自己独特的DNA修复因子,动物细胞 缺乏。但由于细胞壁厚,植物细胞很难发挥作用 用于 DNA 损伤识别。

“到目前为止,GUIDE-Seq 仅是使用培养的动物细胞开发的,”Tang 说。 “在植物中,我们可以通过去除细胞壁来模仿动物细胞,但我们必须 在细胞壁愈合之前迅速将管道胶带引入细胞。”

GUIDE-seq 可能仅限于植物的单个细胞。尽管如此,利用技术 可以帮助评估 DNA 修复中的突变体、检查植物 DNA 修复过程,以及 最重要的是,与其他技术相结合,以确保基因编辑的功效和 准确性。  特别是随着 CRISPR 技术的进步,GUIDE-Seq 工具肯定会 扎根植物遗传学研究。 

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